Politiet svarte med å sende tåregassgranater inn i mengden med demonstranter, som protesterte mot krigen i Irak.
Demonstrantene var samlet få hundre meter unna stedet hvor stats- og regjeringssjefer fra 15 EU-land og 10 tiltredelsesland skal undertegne den høytidelige utvidelsestraktaten.
Tidligere på dagen okkuperte 100 demonstranter ett av kontorene til British Airways i protest mot Storbritannias krigføring i Irak.
Politiet anslo at 7.000 mennesker var samlet til demonstrasjoner ved Syntagma-plassen i Aten sentrum.
Voldsomheter brøt ut da demonstranter forsøkte å bryte politiets sperringer rundt møtestedet hvor EU-lederne diskuterte situasjonen i Irak.
Etter å ha blitt fjernet fra Syntagma-plassen, spredte demonstrantene seg til andre steder i byen.
Steiner, maling og hjemmelagde bensinbomber ble kastet mot både den italienske, franske og britiske ambassaden.
Politiet hadde ventet demonstrasjoner under det to dager lange toppmøtet i Aten. 20.000 politifolk var satt inn i et sikkerhetsopplegg som savner sidestykke i den greske hovedstaden.
(NTB)